随着农村经济的快速发展，许多农村地区环境呈现出工业污染、农业污染、养殖业污染和生活污染相互交织的特征，而目前还存在一些因素制约农村环境综合整治工作的开展，需要分析这些制约因素并提出有针对性的对策。
我国目前农村环境整治工作还存在以下主要问题：
一是地域制约。全国各地农村环境综合整治工作开展情况极不均衡。一些东南沿海城市由于起步早、经济实力雄厚，农村环境综合整治工作已经比较成熟，成效也已显现；而一些中西部地区城市此项工作尚处于起步摸索阶段，在体系、制度、模式等方面还有很多不完善的地方。
二是思想制约。环保工作人员已经认识到农村环境综合整治的重要性和紧迫性，而农村环境综合整治的理念在一些基层相关部门，特别是在广大农民头脑中尚未扎根。
三是经济制约。农村环境综合整治需要通过大量的工程项目加以实现，而在某些城市，市级财政有限的环保投入难以全面支撑各县（市）的整治需求，而县级、乡（镇）级政府财政能够用于农村环境综合整治的财力更为有限。
四是机构制约。多数城市的环保机构设置采取的是市、县两级环保机构模式。随着农村环保工作重要性和紧迫性与日俱增以及任务量逐年加大，两级环保机构模式设置已不能应对越来越繁重的农村环保工作任务。
五是监督制约。一些城市尚未制定农村环境综合整治定量考核指标体系和考核办法，农村环境综合整治工作尚未形成体系，而且缺乏行政首长负总责的考核问责机制。
加强农村环境整治的几点建议 针对农村环境整治工作中存在的问题，笔者有如下建议：
一、以部门联动作为机制保障。农村环保工作是一项系统、复杂、长期性工程，单靠一两个部门难以胜任，需各部门密切配合，协调联动。各地可抽调环保、财政、农业、林业等部门成立农村环境保护工作领导小组，负责协调各方面工作。
二、以创新乡镇环保机构建设作为组织保障。在乡镇及村设置环保机构、配备专职监管员队伍已是客观需要和大势所趋。目前国家对乡镇一级环保机构的设立没有明确统一的规定，地方可以根据当地实际情况在乡镇环保机构的设立方面进行了尝试。
目前有些地区已建立乡镇环保机构，其采用的模式归纳起来有两种：一是在乡镇设立环保办公室，隶属于乡镇政府；二是在乡镇设立环保分局，隶属于县环保局。实际工作中，这两种模式各有利弊。考虑有些地区人员编制紧张等因素，在乡镇环保机构的建设上可采取分两步走的方式。首先在不增加人员编制的前提下，在乡镇政府设立环保办公室，从乡镇政府抽调人员专门负责农村环保工作。待时机和条件成熟后，在乡镇一级设立环保机构，从属于县环保局的乡镇环保分局。
三、以有序推进示范点建设作为方法保障。科学合理地确定示范点。每个城市所辖的各个县（市）的经济发展基础、农村环保工作开展的程度还很不一致，因此在所辖的全部农村范围内一刀切地开展分散式生活污水和垃圾处理等综合整治工作有一定难度，建议先选取一些有代表性的县（市）和村作为示范点开展此项工作，待经验成熟后再以点带面，通过示范点的辐射和带动作用，稳步有序地全面推开。科学合理地确定优化处理工艺。在确定了示范点后，根据示范点地区的自然、经济、环境等具体情况，科学选择适合当地的一次性投入少、运行成本低、运转正常稳定、处理效果好、操作简便、易于维护管理的治理工艺。
四、以拓宽农村环保筹资渠道作为经济保障。逐年提高各级政府环保投入占GDP的比重，特别是加大对农村环境综合整治工作的财政投入。建立“市级政府投入一部分、县级政府配套一部分、乡（镇）政府补充一部分”的三级政府投入体系。加大中央农村环保专项资金向经济不发达地区的投放力度，充分发挥专项资金对这些地区的扶持作用；四是积极探索政府主导、乡村主体、社会参与的多元投入机制，拓宽融资渠道；五是积极争取国际赠款和贷款。
五、以规划编制作为制度保障。目前各地都正在编制环保“十二五”规划，应抓住这一有利时机，在规划编制中着重增加农村环保的内容，同时还应组织各县（市）、区和各乡镇的农村环境综合整治规划编制，形成市、县（市）、乡（镇）三级农村环境综合整治规划编制体系。然后再将规划编制工作下移，以村为单位编制村级环保规划。
六、以目标考核作为监督保障。以环境保护部制定的《农村环境综合整治目标责任制考核办法》及《2010年农村环境综合整治目标责任制考核评价指标》等相关内容为依托，各地市确定各自的农村环境综合整治工作量化考核指标，制定考核办法，并将其纳入本地环境目标考核体系。
七、以加大科技研发作为技术保障。充分利用各地的高校和科研院所的科研技术力量，积极开展技术研究，不断探索开发适合农村地区经济能力的低成本、操作简单、高效的小型实用环保新技术，加快环保科研成果在农村地区的应用转化，特别是适用于不同地区的高效实用技术的研发和推广。
八、以加强农村环境保护宣传作为思想保障。组织大学生志愿者深入农村基层，针对农民的特点，通过编排小品、相声等生动活泼、易于接受的宣传形式向农民宣传普及环保知识，避免空洞、乏味地说教高深的理论。乡镇政府以村为单位开办农民环保学校，定期邀请环保专业人士向农民宣传讲解环保知识。以村为单位编写《环境保护村规民约》，以此约束农民沿袭几代的有违环保的陈规陋习，倡导环保、文明的生活新风尚。
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